兼营不同税率应税交易，需要如何进行分别核算呢？财政部税务总局曾有相关规定，就是把2026年开始施行的《增值税法》第二章提到的兼营不同税率应税交易给分开处理。假如没有单独计算不同税率业务的数据，就给这个交易使用高税率。而《增值税法》的施行条例对一项应税交易的判定标准进行了细化。税务机关主要是通过企业签订的合同、开具的发票还有财务报表来判断你有没有把不同的业务分开算清楚。《财政部税务总局关于增值税进项税额抵扣等有关事项的公告》（2026年第13号）里也对这方面有具体规定。 在签订合同的时候，要是有多项不同税率的业务交易，你得在合同里把不同部分给单列出来，把各项业务的内容和价格写明白。这样做是为了方便之后报税的时候知道该怎么算销售额和成本。在财务核算上也得单独把每个不同税率的业务收入和成本给归集起来。你可以在明细科目里分别设置“主营业务收入-货物销售（13%税率）”和“主营业务收入-建筑服务（9%税率）”，把每个业务对应的收支情况记录下来。这样就能准确算出各业务的销售额和成本了。 开票的时候也不能马虎，得按各项业务对应的税率分开开票。把不同业务名称、金额还有对应的税率在发票上写清楚了。如果没这么干，根据《增值税法》第十二条规定，税务机关就会按高税率来计征增值税了。