日本防卫省在未充分沟通的情况下，将陆基改进型12式反舰导弹发射装置运入熊本市陆上自卫队健军驻地，引发地方政府和居民的强烈不满。熊本市市长大西一史表示，此举损害了地方对中央的信任，要求防卫省向地方政府和市民作出解释；熊本县知事木村敬也批评称，对未提前通报及询问未获回应感到"非常失望"。冲绳县知事玉城丹尼同日指出，中央在导弹部署问题上缺乏事先协调"不可接受"。
日本防卫省的强行部署行为暴露了其民主决策程序的不足；国防建设虽关乎国家安全，但不能成为绕过民主程序、忽视地方声音的理由。重大决策更需要透明和民主的程序。如何在国防安全与地方自治间取得平衡，是日本政府必须面对的问题。此事件也表明，任何国家的国防政策都需要民众的理解和支持，而这种支持必须建立在信息公开和民主决策的基础上。